L'unica cosa che mi viene in mente - senza avere altro su cui basarmi - che tu abbia inserito i dati relativi alle società: capitale sociale, rea e provincia della CCIAA, in liquidazione/non in liquidazione, pluralità di soci: questi dati sono riservati alle società, quindi non vanno caricati nell'anagrafica della ditta individuale... In ogni caso è raccomandabile essere certi di aver inserito i dati fiscali dell'emittente correttamente (CF alfanumerico per ditta individuale e partita IVA numerica).

In teoria, no....
Il modo per individuare se il mittente della fattura (tu, in questo caso) è un soggetto "persona fisica con partita IVA" è essenzialmente la presenza del codice fiscale alfanumerico e la partita IVA (che è sempre numerica).

In Microfatture se inseriti i dati relativi alle società (che hanno sia codice fiscale che partita IVA numerici) vanno inseriti - come accettano sopra - altri dati (REA, capitale soc., ecc.) se esistenti: solo da cio' (e dalla ragione sociale) si puo' desumere che trattasi di una società, quindi non capisco perchè al destinatario sei risultato come società...